Historia de la época colonial

Desde los tiempos de la colonia, Chilibre fue un lugar de tránsito en el Istmo. El camino de Cruces unía la ciudad de Panamá con el pueblo de Cruces, a orillas del río Chagres. Por otro lado, el camino Real cruzaba prácticamente todo el actual corregimiento, desde el puente hasta venta de Pequení y de allí por el río Boquerón hasta Portobelo.

Los diferentes poblados se situaban en los cruces de los ríos y en los dos caminos antes mencionados en antiguos mapas encontramos los pueblos de Cruces, el puente y la venta de Pequení con el declive del comercio por Panamá durante el siglo XVII, los comercios de Cruces y del Rey perdieron su importancia, por lo que los poblados quedaron aislados y abandonados. El camino Real quedó en ruinas. Solo el camino de Cruces recobra por pocos años su importancia durante la fiebre de oro de California a partir de 1848, hasta que se construyó el ferrocarril de Panamá. Al inicio del presente siglo los pocos habitantes de la región se encontraban en Chilibre, Chagres y Calzada Larga.

Aportes para la construcción del Canal

En la construcción del Canal de Panamá se represaron las aguas del río Chagres para utilizarlos como parte de la vía interoceánica. En esta ocasión desaparecieron varios poblados ubicados en las orillas del mencionado río como son Gorgona, Matachín y Cruces. De esta forma también en 1912, cuando estaban terminando los trabajos del Canal las personas que vivían en la cabecera de Pedro Miguel, en un pueblo llamado Calla Boca, fueron trasladados a un lote de 80 hectáreas que en adelante se llamara Agua Buena.

Más tarde, a principios de la década de 1930, se construyó la represa Maden para embalsar agua para el Canal durante la estación seca y a los lados de la carretera Maden Daui se formaron nuevos poblados como son Buenos Aires, Agua Bendita, María Eugenia, entre otros.